Obecně platí: HDD je nejpomalejší součást každého PC a hry (včetně FS) jsou aplikace s nejvyššími nároky na výkon PC.
Pokud mám v FS složku, kde název několikati set souborů začíná AB*, je z hlediska fragmentace důležité, aby tyto soubory byly umístěny na disku fyzicky za sebou. A to ti umožní jen několik defragmentačních programů. A pro některé z nich dokonce existují skripty pro optimalizaci FS souborů.