No, některý jsou. Třeba jedno z nejrozšířenějších účetnictví ÚČTO pro 64bit OS nefunguje a musí se spouštět buď pro tím XP-mod režimem (což mají jen některé edice) nebo pomocí třeba VMWARE.
Ale obecně k tématu - dneska už asi nemá význam pořizovat 32bit verzi, to by k tomu musel mít člověk nějaký hodně pádný důvod.