nejsem jistý tím rozdílem který ti to způsobuje, ale nedivil bych se že jednoduše na tom jendom jádru prostě spousta věcí nestíhá/neběží jak by měla.
To že ti to běží na tom druhém jádru lépe bude zřejmě dáno tím, co tady tvrdím.
Sim se o jádro kde běží hlavní thread musí dělit, tím že necháš jedno jádro ladem znamená že systém se bude snažit případné nové procesy směřovat na to nezatížené jádro a sim může na tom svém lépe dýchat. Zřejmě ale nestačí na vše